淡水鱼生态学发表了关于淡水环境中鱼类生态学各个方面的原创性贡献，包括湖泊、水库、河流和溪流。欢迎涉及以生态为导向的行为、保护、发展、遗传学、生活史、生理学和宿主-寄生虫相互作用研究的手稿。涉及种群生态学和群落生态学的研究也很有趣，进化方法包括种群生物学、进化生态学、行为生态学和历史生态学的研究也很有趣。如果论文有助于对淡水鱼类生态学的一般理解，则考虑解决河口和近海沿海地区溯河和退河物种生命阶段的论文。如果理论和模型研究产生可检验的假设，如对渔业有影响的假设，则它们是合适的。如果手稿产生新的结论或综合，则考虑对已发表数据进行分析的手稿。该杂志发表文章、新观点和评论，偶尔也会发表会议和专题讨论会的记录。