病原体基因组测序项目提供了大量数据，需要根据致病性和感染结果进行设置。此外，病原体与其宿主细胞之间的相互作用对于了解和干扰由微生物病原体引起的疾病变得越来越重要。 IJMM 通过专注于基因组和蛋白质组分析、处理致病性分子机制和病原体进化的研究、病原体和宿主细胞之间的相互作用（“细胞微生物学”）以及分子流行病学来满足这些需求。为了帮助读者跟上医学微生物学领域迅速发展的新发现，IJMM 以平衡的方式发表原创文章、案例研究和专题、最先进的小型评论。所有文章都经过严格的同行评审。每年有两期专门针对特定主题的特刊加强重要主题。最后，在不定期的编辑部分中，对医学微生物学近期或未来发展的当前观点进行了介绍。